在通電不做培養的情況下，應將溫度設定為00℃，將二氧化碳濃底設定為“0"，使水套式二氧化碳培養箱的控制閥處于不工作狀態，從而避免控制閥長期處于工作狀態而損壞。 水套式二氧化碳培養箱門的溫度要設置的比箱內溫度高10℃左右，以降低存取物品時箱內溫度的波動。

  CO2培養箱初次使用一定要加充足水，所加入的水必須是蒸餾水或純水，防止礦物質儲積在水箱內產生腐蝕作用。

  蓋上密封蓋，以減少水套內水的蒸發，未注水前不能打開電源開關，否則會損壞加熱元件;培養箱運行數月后，水箱內的水因揮發可能減少，經常檢查水套的水位，假如水位低就要加水。